回到归化城后，林丹汗立即着手消灭异己，清除部族中可能存在的隐患，强势掌控整个察哈尔部。然后学习借鉴许多大明的做法，在察哈尔部内进行了一些改革。
林丹汗从中挑选精壮，学习大明军制编制了八个师，并以战斗力和装备情况为衡量标准，区分为上三师和下五师。上三师是完全脱产的专业作战部队，下五师就和原来一样是半生产半战斗的部队。
林丹汗又挑选忠心之人，暗中建立类似于锦衣卫的部门，散布在部族中，监视、侦查整个部族，强化自己的统治。
通过一段时间的整治和训练，林丹汗认为已经切切实实实现了对整个察哈尔部的掌控，为了扩大部族的利益，恢复蒙古先祖的昔日荣光，林丹汗决定要发动对建奴以及左翼蒙古各部的征讨。
恰逢此时大明的上直军和征东军团开始向宁锦防线增兵，多次出击锦州，吸引了建奴的注意力，林丹汗当机立断向大明皇帝上奏，然后发兵策应辽西明军。
蒙古族在每年的七、八月份时要举行秋祭，祭敖包，进行大规模祭祀活动，请来喇嘛们焚香点灯、念经颂佛，祈求神灵保佑，消灾消难。许多部族会因此松懈下来。一般来说这时候各部族之间纵使有仇恨矛盾也会暂时搁置一边，先完成祭祀仪式。
但为了自己的目标，林丹汗可管不了那么多了。
天启十一年七月底八月初，林丹汗率上三师辗转千里，突袭了哈剌慎部，斩杀哈剌慎汗拉斯喀布，掳掠了哈剌慎部的绝大部分人口和牲畜。哈剌慎部的驸马苏布地带着残部逃入广宁，依附建奴，但苏布地不久就病死了，哈剌慎部剩余的人口就被皇太极编入了八旗蒙古。
马不停蹄，林丹汗又相继袭击了敖汉部和奈曼部，使得他们不敢分兵去往宁锦一线。随后，林丹汗北上数百里，想要收复自己兴建的都城察汉浩特，意图重返察哈尔故地。
但察汉浩特附近此时已被科尔沁部占据，察汉浩特也有建奴驻扎。
科尔沁部在漠南蒙古诸部中，是实力与察哈尔部相当的一大部族。科尔沁部的土谢图汗奥巴和孔果尔在己巳战役时，脱离了莽古尔泰，自行寻得道路逃出大明，损失也是不小。
回到领地中，奥巴和孔果尔商量，认为建奴经过这次惨败，实力定然大不如前，也不想再卷入大明和建奴的战争之中，就向北迁徙数百里到察汉浩特的北边。
驻扎在察汉浩特的是皇太极的堂兄达尔察。达尔察手下只有几百人，其中只有不到一百名是真正的建奴旗人，此时听闻林丹汗气势汹汹而来，急忙向科尔沁部求援。
在科尔沁部的大帐中，围坐着诸多科尔沁部的贝勒。科尔沁部当时与皇太极入关攻明几乎是倾巢而出，底层士兵损失了几万人，还丢失了大量马匹和武器甲胄，可以说是元气大伤。此时听到林丹汗卷土重来的消息，无不心事重重。
“现在怎么办，各位出个主意吧”
奥巴虽是汗王，但科尔沁内部也是派系林立，各个贝勒多有自己的想法，奥巴空有土谢图汗的名头，却没有汗王的实权，此时坐在上首位也只能引导众贝勒商量对策。
科尔沁内部主要分为三派。
一边是以奥巴和孔果尔老人为首的主张在大明和建奴之间尽量保持独立的中立派。
另一边则是以明安老人为首的已经全面倒向建奴与大明为敌的激进派。
还有一边则是以大、小桑阿尔寨为首的主张迁回兴安岭故地避祸的保守派。