后秦王政后悔，准备将韩非赦免，却发现本在大牢中的韩非下落不明，对外宣称已被赐死。
同年，全力通缉玄女剑以及那伙神秘军队，却无任何消息。
第五年，阴阳家沉寂，罗网沉寂，江湖上暂时失去其消息，昌平君为寻求与墨家合作，帮助燕丹逃离秦国。
魏国被迫把部分土地献秦，韩国亦被迫把南阳地献给了秦，秦王政派内史腾做南阳假守，韩国大将军卫庄下落不明，相国张良艰难维持。
第六年，秦派内史腾攻韩，俘虏了韩王宇，于韩地建置颍川郡，韩国灭亡。
第七年，农家忽遭一队军队围杀，来者自称秦国上将白起之女前来复仇，玄女剑同时出现，农家遭受重创，农家侠魁身死，六大长老重伤。
农家魁隗堂、蚩尤堂、烈山堂、四岳堂、共工堂、神农堂开始争斗侠魁一职。
同年，攻击农家的白起之女与玄女剑再次下落不明，传闻被云烟阁带走。
同年，云烟阁里出现两人，一者为昔日罗网天字一等杀手，代号惊鲵，因怀有身孕，故暂时收留等待公子命令，一者乃是含光剑主，携带一孩童名曰颜路，请求云烟阁收留，陈伯答应了二人的请求。
同年，秦将王翦率领士兵直下井陉，秦将杨端和率领河内兵进围赵都邯郸。
赵派李牧、司马尚带领大军抵御。
赵王宠臣郭开受了秦国贿赂，散布流言说李牧、司马尚谋反。
赵王因此改用赵葱和颜聚代替李牧、司马尚，并且杀死李牧。
第八年，云烟阁中多出一名名曰李镇岳的男子，开始负责云烟阁中所有军务。
秦军大破赵军，王翦、羌瘣尽定赵地，俘虏赵王，赵国灭亡。
秦王政亲赴邯郸，坑杀了自己幼年居住邯郸时的仇家，然后从太原、上郡返回。
赵公子嘉率领其宗族数百人逃到赵的代郡，自立为代王。
秦国在赵都邯郸一带建立邯郸郡。
第九年，荆轲刺秦，天下震动。
荆轲被秦王护卫鬼谷派的盖聂杀死，秦王大怒，命秦将王翦攻燕国。
燕、代两国发兵抵抗，被秦军败于易水以西。
秦国攻占燕国国都，秦将李信带兵追击，燕王喜听从代王嘉的计策，杀太子丹，把太子丹的首级献给秦求和。
第十年，秦王政派将军王贲攻魏，引黄河水灌城，三个月大梁城坏，魏王出降，魏国灭亡。
同年，秦王政派李信、蒙恬带20万大军攻楚，李信攻楚的平舆，蒙恬攻楚的寝，取得初步胜利。
同年，新郑发生叛乱。
昌平君在平定嫪毐之乱中起到重要作用，由于功勋卓着，昌平君被任命为秦国右丞相，深受秦王嬴政的信任，于是派昌平君平定叛乱，叛乱中，昔年大将军卫庄杀死韩王宇后再次消失。
同年，秦王担心楚国旧地也会像韩国一样发动叛乱，便派平乱有功的昌平君前去楚国旧都郢陈安抚旧民。
第十一年，秦王决定灭楚，统军主帅在王翦与李信之间做出选择，秦王犹豫未决。
朝堂上，王翦说需要60万兵才能攻打，而李信中了昌平君的激将法，夸下海口说只要20万人就足够，秦王大喜，遣李信统兵20万伐楚。
同年，李信率秦军进攻楚国，昌平君起兵反秦导致李信腹背受敌从而惨败。
楚国这一战不但收复了失地，还反攻了至秦国境内，此战之后，项燕拥立昌平君为楚