一开始的时候，他其实也想效法赵楷的做法，将天南儒宗和南帝朝廷分开。可是现实摆在那里，赵谌根本不可能同时拥有学派和朝廷两套系统，开销太大，需要的人手也太多这可不仅仅是两套中央班子就够用了，儒宗、朝廷下面还有一堆机构和基层组织，拢共就这点国人，怎么可能都搞双份
所以赵谌在南迁之后，就选用了政治上封建，学派上集权的路线。也就是学派下基层，而政权只到天南八府的府城。久而久之，南帝的政权就渐渐虚化，而学派所管理的事情就越来越多了。
到了洪武二十年后，南帝朝廷干脆关了张，天南儒宗就成了辅弼南帝，号令天南和南洋地区的中央机构，也就是政学合一了。
一大群布衣角巾，腰悬长剑，打扮的和画像上的孔夫子差不多的“大儒”，都在天理宫外按照大小等级排列整齐，设立香案，恭恭敬敬的等候着。
当赵谌、赵椅率领的大队人马抵达天理宫外的天理大街上时，乐手们就开始吹吹打打，还有几声号炮同时响起。同时还有这些天南大儒们异口同声的高呼“南帝出、天理兴，臣等恭迎南帝陛下，恭迎东莞郡王殿下”
赵谌、赵椅对望一眼，笑吟吟的同时下马，略微谦让了一下儿，然后就是椅子王在前，天理南帝在后，昂首阔步的向天理宫内走去。
天理宫的门脸修得气派，进去又是一座非常广阔的广场，广场的东面是文庙，西面是武庙，都是供奉文武先贤的那些为天理事业而成仁取义的“今圣人”的牌位，也都供奉在其中。这文武二庙，就相当于天南儒宗的大祠堂。
而广场的北面，坐北朝南而建的，则是一座天理大殿
这可不是上朝的地方，而是讲道理的地方，相当于天南儒宗的天理堂。
在天南儒宗的传播体系中，祠堂祭先人，理堂传天理。两者的功用不同，但却是二合一的存在。
天理堂“通天”，直通南帝，而大祠堂“接地”，扎根地方宗族。两者合一，就让天南儒宗有了极强的组织和动员能力。
而天理堂的儒者，往往是大祠堂的主持。
赵谌一边陪着赵椅步入天理大殿，一边笑吟吟地介绍说“二十六叔父，这座大殿是去年才落成的，可供千人在其中听道理每月的初一、十五，都会有上千人在此听道，极为壮观啊”
每月的初一、十五是天南儒宗的“听道日”和“祭祀日”，凡是儒门信徒在这两天，都得去天理堂听道理，去大祠堂供先人雷打不动
而在一月之中其余的日子里，儒门信徒还要早晚两柱香，用来敬天供祖。
另外，凡是国人子女，一律要进入儒宗开办的书院念书习武。这些书院和大祠堂、天理堂凑在一起，就是“天理三件套”，书院的院长一般也是天理堂、大祠堂的管理者。
除了祭祖、讲理、教化教书之外，天南儒宗的儒者们还负责济贫、救灾、主持婚丧嫁娶、裁决邻里纠纷等等事宜。
当然了，这些“服务”统统都是要收费的
包括国人在内，天理信徒们都要将收入的十分之一交给天理堂、大祠堂和书院，另外，儒者主持婚丧嫁娶、裁决邻里纠纷时，还要另外收费。
除了天南儒宗的“收费”之外，在天南儒宗治理下的国人、野人，还必须向各自的主公纳税或承担兵役。而这部分税收和兵役，则会一层层的向上缴纳，最后会有一部分交到南帝赵谌手中。
此外，南帝赵谌还能从天南八府的商市、西洋口收费和依附天南儒宗的各国各城邦那