因此技术联盟并不能从银河共和国那里得到能够跟贸易联盟相比的政治地位，甚至于技术联盟在议会当中的议员，也是由斯卡科星球的议员兼任的。并不像贸易联盟和星际银行业协会那样，自己就有独立的议员。
随着杜库伯爵掀起分离主义运动，银河共和国政局不稳，科雷利亚工程公司、夸特动力船坞、爆能科技工业这些超级工业巨头纷纷退出技术联盟，这也让技术联盟开始走下坡路，不断衰弱。
因此在大工头沃特坦伯的带领下，技术联盟决定豪赌一把，他们加入了分离主义，成为独立星系邦联的一员。
沃特坦伯同样打算效仿贸易联盟，在独立星系邦联和银河共和国之间两头下注，两边赚钱，但是他们怎么可能跟贸易联盟相比贸易联盟一句话，银河共和国连在外环星区征税都做不到，技术联盟说句话能顶什么
因此克隆人战争一爆发，银河共和国虽然没有撕破脸直接进攻斯卡科星球，但那主要还是因为斯卡科星球防御非常坚固，在大共和国军刚刚建立的时候强行进攻得不偿失。不过，银河共和国依然冻结了技术联盟在自己控制区域的所有资产，关闭了他们的工厂，勒令加盟技术联盟的企业退出联盟。
所以在战争初期，技术联盟对银河共和国是恨之入骨，在战争当中出力巨大。而他们也是继黎明星球之后，第二个消灭了银河共和国整个军团的势力他们攻陷赖洛斯星球，摧毁了共和国第14军。
但是随着战争的推进，黎明星球开始为独立星系邦联了越来越多的技术支持和工业支持，因此黎明星球除了体量不足之外，其他为独立星系邦联的服务其实是和技术联盟重合的。
而且黎明星球那边，无论是战舰还是战斗机，其性能都远远超过技术联盟自己能够的。再加上自从夸特动力船坞和科雷利亚工程公司退出之后，技术联盟自己设计制造大型主力舰的能力大打折扣。
所以在独立星系邦联军中，技术联盟的优势越来越小，许多订单都交给了黎明星球。
在后来独立星系邦联的海军改革之后更是如此，新一代独立星系邦联海军几乎一半的战舰型号都是黎明星球的。
技术联盟不是没做过努力，他们推出了自己的主力舰设计堡垒级战列巡洋舰buarkcssbatteshi。不过这种战舰推出时间太迟，虽然杜库伯爵出于想要制衡黎明星球的想法，也给出了大量订单，但是最终完成建造的堡垒级数量却并不多。
感受到地位受到威胁的技术联盟，他们和银河共和国对抗的决心开始动摇。大工头沃特坦伯开始暗中联络银河共和国，开始探讨重归共和国的可能性。
不过那时候的银河共和国已经不比战争爆发初期了，他们要接纳技术联盟，自然是有条件的。他们要求技术联盟为他们泄露独立星系邦联的军事机密，尤其是黎明星球的一些战舰技术。
沃特坦伯却又优柔寡断，担心自己真的这么做了，独立星系邦联很快就会失败，而技术联盟也就会失去利用价值。
所以在这样的患得患失之下，技术联盟就一直左右摇摆，直到后来独立星系邦联在萨鲁卡米星球战役当中失败，他们才下定决心投降银河共和国。
这样的结果自然不会好，你46年投降和49年投降能一样吗
因此在银河帝国当中，技术联盟为了生存下去交出了大量的金钱、工厂和技术，