于是上书争辩。
    其实，袁崇焕开始并不是非要杀他的。
    他主动要求“在皮岛设朝廷监军，粮饷仔细发放。”
    为了使毛文龙顾全大局，明白自己的良苦用心，袁崇焕和毛文龙连续谈了三天三夜。
    但是，毛文龙独揽大权已久，他直接拒绝了袁崇焕，表示不想受到朝廷的管制。
    虽然，遭到了反对，但是，袁崇焕仍然抱有一线希望。
    他劝说毛文龙，想让他急流勇退，主动放弃皮岛的兵权。
    但是，敛财巨多的毛文龙仍然不满足，他再次表示拒绝。
    崇祯二年六月，袁崇焕以阅兵为名，来到了毛文龙所在的皮岛。
    袁崇焕同他设宴饮酒、行乐，每每到半夜才罢，毛文龙丝毫没有觉察袁崇焕的意思。
    袁崇焕同他龙很不高兴。
    袁崇焕用离职返乡劝说他，毛文龙回答说“以前有这个意思，但现在只有我了解东部战事，等东部战争完毕，朝鲜衰弱，可以一举而占有。”
    袁崇焕更加不高兴，就在六月五日这天邀请毛文龙来观看将士们射箭，先在山上设了帷帐，命令参将谢尚政等安排身穿铠甲的士兵埋伏在帐外。
    毛文龙来后，他手下的士兵不能进帐里来。
    袁崇焕说“我明天出发，海外的事情全寄托在您身上了，请受我一拜。”
    互相拜见之后，一起登上山来。
    袁崇焕问起他随从军官的姓名，多是姓毛的。
    毛文龙说“这些人都是我的孙子。”
    袁崇焕笑了，说道“你们在海外劳苦多日，每月禄米也只有那么一斛，说起来痛心呢，也请受我一拜，大家都为国家尽力。”
    这些人都叩头道谢。
    袁崇焕借着将要离去的由头，就此诘问毛文龙几桩违令的事情，毛文龙做了对抗性的辩解。
    袁崇焕高声喝斥他，让人扒下他的帽子和袍带，把他捆了起来，毛文龙仍很倔强。
    袁崇焕说“你有十二条该斩头的大罪，知道吗
    按我朝祖宗定下来的制度，大将领兵在外，必须接受文官的监视。
    你在这边一人，军马钱粮都不接受核查，一该杀。
    大臣的罪没有比欺骗君主更大的，你送上奏章全都蒙骗，杀害投降的士兵和难民，假冒战功，二该杀。
    大臣没有自己的将领，有则必杀。
    你上书说在登州驻兵取南京易如反掌，大逆不道，三该杀。
    每年饷银几十万，不发给士兵，每月只散发三斗半米，侵占军粮，四该杀。
    擅自在皮岛开设马市，私自和外国人来往，五该杀。
    部将几千人都冒称是你的同姓，副将以下都随意发给布帛上千匹，走卒、轿夫都穿着品官官服和袍带，六该杀。
    从宁远返回途中，劫掠商船，自己做了盗贼，七该杀。
    强娶民间女子，不知法纪，部下效仿，使得百姓不安于家，八该杀。
    驱使难民远远去帮你盗窃人参，不听从的就被饿死，岛上白骨累累，九该杀。
    用车送金子到京师，拜魏忠贤为父，并在岛上雕塑他加冕冠的肖像，十该杀。
    铁山一战败北，丧师不计其数，却掩败为功，十一该杀。
    设镇八年，不能收复一寸土地，坐地观望，姑息养敌，十二该杀。”