然而，历史的发展难以预见。
叶赫那拉氏族和爱新觉罗氏族总是在敌人与朋友之间徘徊，是敌人的时候，难免要打上几仗；是朋友的时候，便开始联姻。
是战是和，都是视当时的情况和利益而定。
事实上，叶赫那拉氏和爱新觉罗氏世世代代都是血统之亲，努尔哈赤不但是叶赫那拉氏所生，还娶了叶赫那拉部落的女子。
努尔哈赤的儿子皇太极便是叶赫那拉氏孟古所生。
万历十九年，哈达部贝勒歹商爱慕东哥的美貌，最先向叶赫求婚。
正在寻隙与哈达仇杀的叶赫贝勒布塞和纳林布禄让歹商亲自迎娶。
歹商不知是计，在迎娶的途中被叶赫伏兵所杀。
努尔哈赤既不是哈达部人，也不是叶赫部人，但他迅速崛起后，却得到了明朝的承认，被授为都指挥使，成为建州女真的著名首领，实力大增。
因此，努尔哈赤同其他部落的关系也开始恶化。叶赫部当时是女真最大的部落，感到自己的优势受到了威胁，叶赫首领纳林布禄向努尔哈赤提出了领土的要求，被努尔哈赤拒绝。
叶赫部纳林布禄便率领哈达、辉发部，联合满蒙九大部落攻打建州。
为了联盟对付建州，乌拉部贝勒满泰为弟弟布占泰聘娶了东哥。
叶赫部布塞首领纳林布禄的哥哥，东哥的父亲出于结盟的需要，同意了这桩婚事，并接受了满泰的聘礼。
于是，布占泰以叶赫女婿的身份，率三千乌拉兵加入了九部联军。
但战争的结果却大出人意料，努尔哈赤以少胜多，击败了九部联军。
东哥的父亲布塞在这一战中战死，乌拉部布占泰也被俘虏。
叶赫部首领纳林布禄见其兄被杀，吓得跌下马来，被手下救了回去。
据说，后来纳林布禄向努尔哈赤索要兄长布塞的尸体。
努尔哈赤竟然亲自将布塞的尸体割下一半，送还给了纳林布禄。
纳林布禄受了惊吓和侮辱，又哀伤兄长惨死，日夜啼哭，不久也抑郁而死。
从此，叶赫与建州结下了不共戴天的仇恨。
明万历四十六年，在明朝的支持下，叶赫贝勒金台石的儿子率军进攻了努尔哈赤统治下的后金。
第二年正月，努尔哈赤便给予了狠狠的报复。
同年，明朝鉴于努尔哈赤太过于猖狂，东北各部几乎都被他征服了，于是派辽东经略杨镐率四路大军前往剿灭。
这就是历史上有名的“萨尔浒大战”。
叶赫部也参战了，打算助明军一臂之力，结果明军大败，叶赫见到明军战败，慌忙撤退。
这次大战之后，明朝丧师失地，为挽回辽东局势，明朝派熊廷弼经略辽东。
于是努尔哈赤调转兵锋，集中力量进攻叶赫部，同年八月，努尔哈赤发下誓言“不克叶赫，誓不回师”
率大军亲征叶赫。
叶赫出战不利，金台石、布扬古分别固守东、西二城。
努尔哈赤命后金军掘地为穴，城墙倒塌，后金军攻入城中。
金台石拒不投降，而死，布扬古见东城已破，孤城无援，在得到降后不杀的保证后，才盟毕出降。
努尔哈赤为防止叶赫东山再起，这次没有履行诺言，杀了布扬古，叶赫部遂告灭亡。
努尔哈赤将叶赫的平民迁到建州，入籍编旗，变成了自己的臣民。
叶赫部首领布扬古临死前曾对天发誓“我叶赫那拉就算只剩下一个女人，也要灭建州女真。”