于是公民们战意昂然，一致同意要与准备毁灭雅典的戴奥尼亚人决一死战。
雅典人已经做好了全面防御的准备，而两支戴奥尼亚军队会师之后，有自知之明的克洛托卡塔克斯主动将统一的军事指挥权让与帕特洛克罗斯。
帕特洛克罗斯没有推辞，但也没有马上就对雅典城发起进攻，而是命令这10万军队绕着雅典城先修筑牢固的营地这10万部队不止包括克洛托卡塔克斯和帕特洛克罗斯所率领的戴奥尼亚军队，还有底比斯、曼丁尼亚、阿哥斯、科林斯、麦加拉等盟邦军队。
同时，他还分出部队横扫整个阿提卡地区，在攻占村镇之后，就将未能及时逃入雅典城的村镇民众全部赶到雅典城下，然后军队立刻远离。
这些民众在城外哀嚎，城内的士兵见没有什么危险，就立刻打开城门，放其入内。
卡利斯特拉图斯和伊菲克拉特斯等人根本不能阻止，因为这些民众都是雅典人，是城内公民们的亲属或亲戚，所以在几天之内雅典城就容纳了整个阿提卡地区的人口，达到了近30万人。
虽然说雅典是希腊本土最大的城市，加上比雷埃夫斯港，整个城区面积超过了20平方公里，但如此庞大的人口还是给整座城市带来了很大的生存压力很多逃入城内的阿提卡居民没有居住的地方，就直接睡在公共建筑的庭院和广场，甚至从比雷埃弗斯到雅典卫城的道路两旁随处可见民众搭建的临时窝棚，自然也就无法保证城内的卫生整洁，到处都是排泄物，很少有人去清理，而且现在还是9月末，气温还较高，到处苍蝇蚊子乱飞，臭气熏天。
对于将军们而言，这还是小问题，让他们头疼的主要是粮食。虽然当初为了组织联军同戴奥尼亚开战，事先在城内囤积了不少粮食，但面对如此大的人口压力，依然感到吃紧。卡利斯特拉图斯等人不得不花费一番口舌，说服500人议会，然后组织人手，严控粮食的消耗。
此外，饮水也是一个问题。雅典地区本来有几条河流，但它们都在城区之外，在戴奥尼亚军队的控制之下，因此城内民众只能依靠城内的一个个水井，城内居民和城外难民经常因为争夺水井的使用权发生争执、甚至冲突，雅典政府不得不增派人手来维持每个水井的取水秩序。
而在这个期间，几名曾经多次参加戴奥尼亚学园医学院举办的希腊医学论坛的雅典医生一起向雅典政府提出警告必须要尽力保证城内的清洁，否则太过肮脏的环境会导致瘟疫的发生。
他们的建议引起了将军执行委员会的重视，要知道当年伯罗奔尼撒战争开始之后，斯巴达联军从陆路进攻雅典，当时雅典也是据城防御，情况和今天并无太大不同，但没过多久城内就发生了一场大瘟疫，伯里克利也染病故去。虽然这几名医生声称“他们所了解到的这些知识都是学自戴奥尼亚医学院”，但雅典将军们并没有因此而忽视，毕竟这些年戴奥尼亚的医学水平高已经逐渐得到东地中海的一些城邦的认同，而且瘟疫给雅典人造成的噩梦太过可怕，因此即使是仇敌，卡利斯特拉图斯等人仍然决定采纳他们的建议，派出大量人手，每天负责清理街道，尽力保证城市的清洁。
还没有正式交战，以卡利斯特拉图斯为首的雅典高层就已经因为城内暴增的行政事务而心力交瘁，而民众也在紧张、恐慌和忙碌中艰难的度过每一天。
但是戴奥尼亚的军队依然没有发起进攻，只有各军团的弩炮队在帕特洛克罗斯的命令下，均匀分布在雅典城周围，开始大量的向雅