他的心中，其实也是非常奇怪，从来就没有直接联系的皇帝，竟然会给他一道密旨。让从未接过圣旨的他，不由得有点新鲜和期待。
另外，他也知道，一直躲下去也不是办法，中丞大人那边，肯定已经很恼怒了。除非自己是决心和朝廷翻脸，要不然的话，就不能再一直躲下去的。
于是，过了半个时辰左右，他一身汗地出现在前院，匆匆赶去大堂，姿态放得非常低，连声称罪，同时主动解释道“大员的那些红夷不安份，不得已，末将亲自赶过去收拾了他们一顿。回来晚了，还请诸位大人见谅”
红夷和大明的关系一直是算敌对的，他这么说，相信也没人能戳穿这个借口。
锦衣卫总旗在郑府内好吃好喝地伺候了一顿，缓解了那种闷热之感，心情已经没有那么糟了。此时又看到郑芝龙会来事，姿态放得那么低，心中多了一点好感，也就没有为难他，便让他把不相关的人都清退出去，就把密旨给了他。
郑芝龙心中好奇之下，展开密旨看了起来。
虽然他猜着应该不是坏事，可当他看了一会后，那额头得汗，又重新流了下来，就犹如他刚从外面进来一般。同时，他的脸上都是震惊之色。
原来，崇祯皇帝在这道密旨里面，就直接开门见山地跟他说了。
主要内容就是说皇帝是知道他郑芝龙在海上的实力，也知道他在干什么勾当。不过念在他并没有像北地晋商那样为祸大明，从某个方面上来说，他郑芝龙还维护了大明沿海的平安。因此，对于郑芝龙以前的那些事情，皇帝都不打算追究了。
但是，崇祯皇帝在密旨中警告郑芝龙，像这种要海船交钱挂郑家令旗的事情，就别指望着能一直干下去，这是朝廷律法不允许，也是他崇祯皇帝所不允许的。
水师是大明的水师，不是郑家的水师；大海是大明的大海，不是郑家的大海；这种事情，真要认真追究起来，就也是有谋逆的嫌疑
崇祯皇帝在密旨中明确告诉郑芝龙，不久的将来，朝廷一定会关注海上。到时候，不止是福建水师一支，还会陆续重建登莱水师，苏浙水师，和广东水师；并且大明水师的目标，也不再只是巡哨沿海。海的尽头，也得有大明水师的旗帜
而他郑芝龙唯一的出路，就是趁如今大明水师还在重建之初，给予朝廷最大的助力。唯有如此，方能论功行赏，封妻荫子，封侯赐爵也是可期的。
如今，为对付辽东建虏，登莱水师要尽快重建。因此，调他郑芝龙去加速重建，消灭建虏的水师，就是大功一件。而福建这边，也可以给他郑芝龙三年时间的缓冲。之后，就要逐步纳入朝廷水师的正规编制，而不再只是他郑芝龙的水师
同时，崇祯皇帝也明确表示，他已经给了足够的耐心，希望郑芝龙不要执迷不悟。除非他是想造反，否则就不要错过这次机会。封他为登莱水师总兵官，立刻领水师北上，听从保定总督调遣，重建登莱水师，在对虏战事中发挥他该有的作用
在密旨的最后，崇祯皇帝还表示很欣赏他儿子郑森，让郑森北上京师国子监就读，并为太子伴读。
郑芝龙看完这道圣旨，还是没有察觉自己已经汗如雨下。他明白，这道密旨其实是崇祯皇帝最后的通牒，要么服从调遣，要么就造反，只有这么两条路可选。
虽然是最后通牒，可从这份密旨中，他也感觉到了皇帝对他的苦口婆心，希望他能做出正确地选择。去挣一个封妻荫子，封侯赐爵；要不然的话，就只有刀兵相见。
与此同时，郑芝龙也很吃惊。因为崇祯皇帝在这份密旨中，直白地说了他的雄心壮志海的尽头，也得有大明水师的旗帜这样的愿望，是以前的皇帝从来